DEVIS DE 1983
| GRAND-ORGUE | RÉCIT EXPRESSIF | PÉDALE | |||||
| Montre | 8' | Bourdon | 16' | Principal | 16' | ||
| Rohrflöte | 8' | Bourdon | 8' | Bourdon | 16' | ||
| Dulciane | 8' | Principal | 8' | Octave | 8' | ||
| Prestant | 4' | Viole de gambe | 8' | Bourdon | 8' | ||
| Flûte harmonique | 4' | Voix céleste | 8' | Octave | 4' | ||
| Doublette | 2' | Principal | 4' | Bombarde | 16' | ||
| Fourniture | III | Flûte bouchée | 4' | ||||
| Trompette | 8' | Sesquialtera II | 2 2/3' | ||||
| Octavin | 2' | ||||||
| Larigot | 1 1/3' | ||||||
| Sifflet | 1' | ||||||
| Hautbois | 8' | ||||||
DEVIS DE 1925
| GRAND-ORGUE | RÉCIT EXPRESSIF | PÉDALE | |||||
| Montre | 8' | Bourdon | 16' | Flûte | 16' | ||
| Flûte double | 8' | Bourdon | 8' | Bourdon | 16' | ||
| Mélodie | 8' | Principal | 8' | Bourdon doux | 16' | ||
| Dulciane | 8' | Viole de gambe | 8' | Flûte | 8' | ||
| Prestant | 4' | Voix céleste | 8' | Bourdon | 8' | ||
| Flûte harmonique | 2' | Violon | 4' | Bombarde | 16' | ||
| Doublette | 2' | Flûte | 4' | ||||
| Trompette | 8' | Octavin | 2' | ||||
| Cornet III | 2 2/3' | ||||||
| Voix humaine | 8' | ||||||
| Hautbois | 8' | ||||||
| Trompette | 8' | ||||||
Le 10 août 1890, on fait l'achat d'un harmonium, dont 150 $ sont payés par la fabrique et le reste grâce à une souscription volontaire des paroissiens, remboursable dans trois ans.
Le 30 novembre 1924, décision est prise d'acheter un orgue Casavant Frères ltée au coût de 10 150 $, dont 3 385 $ lors de l'installation et le solde sur billets.
Le 1er juin 1925, Mlle Cécile Lavoie, organiste attitrée, reçoit une augmentation de salaire. Elle recevra maintenant 350 $ par année. Elle revenait de deux mois d'études chez M. Henri Gagnon, organiste à la basilique de Québec.
Cet orgue a subi plusieurs transformations. Lors de la première en 1951, l'orgue est descendu de sa tribune, d'où il bouchait la grande fenêtre centrale. Une magnifique verrière a été posée dans cette fenêtre. À cette occasion, l'orgue a été divisé en deux sections comme il est aujourd'hui.
L'organiste fait face aux deux buffets qui sont placés à deux mètres de la console.
Entre 1960 et 1969, les anches des claviers manuels disparaissent pour faire place à des mutations. En 1979, M. Louis-Auguste Guillemette renforce l'harmonisation de l'orgue pour 2 700 $. Puis, en 1983, Orgues Marcel Bertrand refait l'harmonisation au complet en plaçant deux jeux d'anches ainsi qu' une Fourniture de trois rangs aux claviers manuels.
Les organistes: Mlle Cécile Lavoie (1925- ), M. Paul Gagnon (1955-1971, 1978- ), M. Marcel Jean (1965-1982, 1986- ), M. Jean-François Tremblay, Mme Mélanie Tremblay (1993- ).
M. Paul Gagnon joue les orgues de la cathédrale Saint-Jean-sur-Richelieu à dix-neuf ans. De 1947 à 1955, il est organiste à Sainte-Marie de l'Isle-Maligne, de 1955 à 1971, à Saint-Joseph, de 1971 à 1976, à Saint-Pierre. En 1976 et 1977, il est en poste à Saint-Jérôme de Métabetchouan avant de revenir à Saint-Joseph d'Alma. Il a également dirigé le choeur des professeurs d'Alma et la chorale Aquilon (source: " Progrès-Dimanche ", 21 février 1993).